以形而上的理为微，以形而下的气为品，以显微关系，解不理气关系

朱熹依据这种太极观，讨论了太极同阴阳、五行以及天地万物的关系。周敦颐的《太极图说》说：“五行一阳阳。“朱意依此，将五行之气归结为阴阳二气。他说：“盖五行异质，四时异气,而皆不能外乎阴阳。”(《太极图说解》)但阴阳二气义从何来，如何理解周氏说的“阳阳一一大极？”朱熹着重探讨了这一问题。其论太极和阴阳二气的关系说：

◎此所谓无板而大极也，所以动而为阳，静而为阳之本休也。然非有以离乎明阳也，即阴阳而指其本体，不杂乎阴阳而为言耳。（《太极图说解》）

此◎,指太极图式中的最上一圈，朱熹以其为太极之理，认为此理乃阳动阴静之本体,但此木休并不离开阳阳二气，即在阴阳二气之中，指其中小口,此即”即闲而指其本体”。但此本体又同附阳二气有区别，最在阴阳之中，却保持自己的死立性,此印〝不杂乎阴阳而为言耳”。这两向，是朱熹论太极同二气关系的基本观点。他解释说：

熹前书所谓大极不在阴阳之外者，正与采教所谓不倚于阴阳而生阴阳者合。但熹以形而上下者，共实初不相杂，故日在阴阳之中。吾丈以形而上下者，其名不可相杂，故日不在阴阳之外。虽所自而言不同，而初未尝有异也。（《文集•答程可久》）

程可久的太极说，详情不得而知。照朱熹所引，似乎亦主张太极不旁阴阳，即“不在阴阳之外。”朱熹认为这同其《太极图说解》中的观点，基本上是一致的。但朱熹的论点是，太极和阴阳二气乃形上和形下的关系，二者本有区别，即“其实初不相杂”但又相互联系，太极又在二气之中，即“不离乎阴阳”。‘不杂于阴阳”，谓太极乃形而上之理，不同二气相混杂。此种观点，他在同陆象山的辩论中，又称为“在阴阳之外而未尝不行乎阴阳之中。”（《文集•答陆子静》）〝在阴阳之外”，仍指“不杂乎阴阳”，不是说脱离阴阳二气。“未尝”，表示太极之理始终寓于阴阳之中。他又解释这种不即不房的关系说：“性犹太极也、心犹阳阳也。太极只在阴阳之中,非能离阴阳也。然至论太极自是太极，阴阳自是阴阳，惟性与心亦然。所谓一而二，二而一也。”(《语类》卷五)此是从人性论角度说明太极和阴阳二气既有联系，又有区分。朱熹此说，同其旅法中的太极说，即太极分而为两仪，又寓于两仪之中的观点亦是一致的。

朱熹于《大极图说解》中，进一步论述二者的关系说：

太极，形而上之道也。阴阳，形而下之器也;是以自其著者而观之，则动静不同时，阴阳不同位，而太极无不在焉。自人微者而观之，则冲移无朕，而动静阴阳之理，已悉具于其中矣。

〝著者”，指阴阳二公元，“微者”，指太极之理。此是以道和器的范畴，说明太极和阴阳二气的关系。是说,就阴阳二气说，其流行不同时，其对待不同位，但太极理即在其中。就太极说，无声无形，但阴阳动静之理皆具其中。他以形而上的理为微，以形而下的气为品，以显微关系，解不理气关系。此是以程氏易学的“显微无间“说，说明太极之理和阴阳二气乃不即不离的关系。据此，他又解释太极说：

太极非別为一物，即阴阳日而在阴阳，即五行而在五行，即万物而在万物，只是一个理而已。因其极至，故名日太极。（《语类》卷九十四）