患者有老少之分，脏腑有虚实之殊;贫富不一，致病原因多异;即病症相同，亦当因人而治
中医论病处方，从来重视正确处理常和变的关系。逆者正治，从者反治，一从一逆，一反一正，深刻地揭示了药病之间的常变关系。正治，逆病症用药，乃常理;反之，从病证用药，乃变通。故李时珍说：“虽然岁有四时，病有四时。或春得秋病，或夏得冬病，神而明之，机而行之，变通权宜，又不可泥一地。”(《本草纲目•序列•四时用药例》，第一册，74 页)研究病理、药理的常变关系，正是为了克服，不化的形而上学思维方法。
患者有老少之分，脏腑有虚实之殊;贫富不一，致病原因多异;即病症相同，亦当因人而治。这就叫常和变辩证统一。李时珍引用张仲景的论述来阐明这一思想：“土地高下不同，物性刚柔食居亦异。是故黄帝兴四方之问，岐伯举四治之能。且如贵豪之家，形乐志苦者也;衣食足则形乐而外实，思虑多则志苦而内虚。故病生于脉，与贫下异，当因人而治。后世医者，委此不行，所失甚矣。”(《本草纲目。序列•神农本经名例》第一册，52 页)古今名医正因其善于“因人而治”，常穸统一，故能取得成功。一药不可治众人之病，同病不可以一理概论。常其所常，变其所变，常与变的辩证统一，乃神医妙术之精微。李时珍借寇宗殖的论述，阐明这一原理。宗壺曰：“人有贵贱少长，病当别论;病有新久虚实，理当别药，盖人心如面，各各不同;唯其心不同，脏腑亦异。欲以一药通治众人之病，其可得乎?”(《本章纲目•序例.神农本经名例》第一册，52 页)“病当别论”，“理当别药”，即对具体病症进行具体分析，坚持辨证的常变统一。反对千人一律，刻板硬套。
十剂之中有燥剂，燥剂的功效在于祛湿。逐湿必赖燥剂，这是医理之“常”。然而如何逐湿，则有各种特殊手段，这是医理之权变。李时珍首先分析了湿征的类型及成因：“湿有外感有内伤”。外感之湿，起于“雨露岚雾地气水湿，袭于皮肉筋骨经络之间”;内伤之湿，“生于水饮酒食及脾弱肾强”。因此，逐湿的燥剂当因人而异，治疗方法是多变的。“风药可以胜湿，燥药可以除湿，淡药可以渗湿，泄小便可以引湿，利大便可以逐湿，吐痰涎可以祛湿。湿而有热，苦寒之剂燥之;湿而有寒，辛热之剂燥之。”(《本草纲目•序例•十剂》，第一册，63 页)关于干燥剂的诸种常变关系，都是对具体情况进行具体分析的结果。人们认识物化之“常”，则可以适应千变万化之征;对同类病症诸种表现有所认识，才能概括医治同类病症的常理。医学、药学中的原理原则，“十剂”“四时用药例”等均从千百年医药实践经验中总结出来，属于“常”的范畴;《本草纲目》所载各种经方、时方、验方、单方，都是在常理指导下的具体运用，属于“变”的范畴。名医辨证论治，执“常”应万“变”，万“变”不失“常”，无不对常和变的辩证统一原理成竹在胸。
四气五味，药物之本性不变，君豆佐使的配伍则千变万化。七方、十剂固有常则，施之于人，则补污政养，效用悬殊。故李时珍指出：“甘缓、酸收、枯燥、辛散、咸软、淡渗，五味之性，一定而不变者也;其或补或污，则因五脏四时而互相施用者也。温凉寒热，四气之本性也，其于五脏补污，亦互相施用也。”(《本草纲目•序例•五脏五味补污》，第一册，78 页)《神农本草经》谓药有“七情”，即相须、相使、相反、相恶、相畏、相杀。不只相须、相使者可以同用;相畏、相杀者，相恶、相反者同样可以并用，正如李时珍指出的：“有经有权，在用者识悟尔。”(《本草纲目 •序例•神衣本经名例》，第一册，46 页)若因药有相畏相杀之性，就一概拒绝同用，是株守常理而不知权变了。李时珍引用陶弘景的话论述这一思想：“凡检1日方用药，亦有相恶相反者。如仙方甘草丸有防己、细辛，俗方玉石散用栝楼、干姜之类。服之乃不为害。”“半夏有毒，须用生姜，取其相畏相制也。”“牛黄恶龙骨，而龙骨的牛黄更良，此有以制伏故也。”(同上)这些都是“有经有权”的典型方剂。根据变通权宜的辩证原则处方，可谓得医理药理之枢密。这正是李时珍所经常倡导的。
李时珍对药物学的重要贡献之一，在于强调药物的归经有别。药物性味不同，固然归经有定准，但亦存在常与变的辩证关系。药物归经，可通过配伍有所改变，这才是李时珍所注重研究的地方。常山、蜀漆(即常山苗)是祛痰截疟要药。但疟有各种，有五脏之疟，有六经之疟。根据疟之类别，需要改变常山、蜀漆之归经，其方法则在改变其佐使。李时珍指出：常山“得小麦、竹叶则人心;得秫米、麻黄则人肺;得龙骨、附子则人肾;得章果、槟榔则人脾。”(《本草纲目 •常山、蜀漆•发明》，第二册，1151 页)如既不知疟起于何经与何脏，又不知常山蜀漆因佐使不同而改变其归经，只知常山蜀漆可以截疟，知常而不知变，如此投药，断断为名医所不取。庸医不知常变之理，以为一药可通治众人之病，李时珍对之作了尖锐批评。
李时珍以毕生精力深研以《周易》为代表的传统哲学，和以《黄帝内经》为代表的祖国医学理论，坚持革新精神，创立了辚新的《本草纲日》体系，对朴素辩证法思想做出重大发展。《本草纲日》不只是中医药学的丰碑，也是研究传统哲学的瑰宝。李时珍的哲学为医学界留下了优良传统，也是中国哲学界引以为自豪的智慧结晶。亡援引易象、易理以分析医理、药理，为医易相通树立典范，值得深思精研。
